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新技术助力非编码RNA研究

 2020/6/30 9:29:55 《最新论文》 作者:中国科学报 我有话说(0人评论) 字体大小:+

本报讯(记者张行勇)西北大学生命科学学院教授严健、张亮、陈居明带领的西北大学与香港城市大学联合研究团队,成功开发了一种检测活细胞内RNA与蛋白质相互作用的新技术,并取名为CARPID ,可助力非编码RNA研究。相关研究成果近日在线发表于《自然—方法》。

长链非编码核糖核酸(lncRNA)被认为是基因组中的主要“暗物质”。目前生物医学界越来越多的研究表明,这些RNA分子可能参与细胞内一系列重要的生理活动,与肿瘤发生发展也有着密切关系,如DNA突变引起肿瘤的发生。而DNA突变可能会改变相关蛋白质的序列和功能,如造成信使RNA序列的改变等。

据团队相关专家介绍,相较于以往的方法,CARPID的优势在于它不需要经过预先的小分子或者高能紫外线的交联,而是在生理条件下检测活细胞的lncRNA与蛋白质相互作用,可以有效避免交联所产生的系统性误差。此外,由于其他方法几乎都需要设计多个RNA探针来富集目标lncRNA,对于细胞中含量比较低或者长度比较短的lncRNA技术难度较大。

CARPID大大提高了方法的敏感性,也相对简便。该技术具有广泛的应用前景,包括寻找在肿瘤发生过程中具有重要作用的RNA结合蛋白,以及用于发现新冠病毒RNA基因组侵入人体细胞后的重要结合蛋白,这些蛋白分子或许可以作为治疗相关疾病的药物靶点。

相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41592-020-0866-0

来源: 中国科学报

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