Yuwen Liu课题组简介

Yuwen Liu，研究员、博士生导师。入选国家重大人才工程（青年）、广东省高层次人才（青年）、中国农业科学院“农科英才”领军人才B类、深圳市高层次人才B类，深圳市“青年五四奖章”获得者。2006年于清华大学本科毕业，2014年在芝加哥大学取得博士学位。Yuwen Liu研究员在基因组和表观遗传学领域有着十多年的科学研究经历，在学术研究上擅长开发实验和计算方法，从非编码调控区入手解析经济动物复杂性状的遗传基础，以及基于细胞调控线路设计的合成生物学育种。以第一作者（含并列第一）和通讯作者（含共同通讯）作者在Genome Biology，American Journal of Human Genetics, JACS, Bioinformatics等高水平杂志上共发表文章7篇，以共同作者在 Nature Genetics, Nature Communications 等高水平期刊发表十余篇文章，Google Scholar总引用1000多次。开发了首次直接测量定位全基因组高通量增强子的WHG-STARR-Seq、首次测定了上万GWAS关联性SNP对增强子功能影响的allele-specific STARR-Seq和首次将增强子、DNA变异整合分析拓展到新生突变的统计算法TADA-Annotation。在产业转化上，开发了基于靶向二代测序的伴侣动物基因检测液相芯片，可以通过品系鉴定，遗传病筛查和亲缘关系鉴定提升遗传改良效率，获批三项国家专利，获得产业投资400万元进行产业转化。开发了基于超低覆盖度全基因组测序数据的基因型分型计算方法，领导团队开发了适用于二倍体农业动物和作物的高效低成本基因型分型和基因组选择平台，获得首届广东省种业科技大比武总决赛十强，2021年深圳市创新创业大赛大鹏赛区农业赛道第一名，并以此平台依托基因组所孵化中农芯跃分子育种公司。现主持十四五国家重点研发计划课题、国家自然科学青年科学基金项目、国家自然科学面上项目以及深圳科创委面上项目共4项，核心参与了广东省基础与应用基础研究基金项目、中国农业科学院科技创新工程重大科研计划共2项。

研究方向：

主要专注于开发新的实验和计算方法，研究转录调控中的增强子定位和功能，非编码区DNA变异如何通过影响增强子功能而影响生物性状，以及如何通过人工设计调控增强子等调控元件改变生物性状，方法具有普遍适用性，同时在解析猪产肉性状遗传机制解析中进行深入应用。具体研究方向包括：

1.结合基因型数据，表型数据和多组学功能注释数据，解析GWAS信号和选择进化信号，从而挖掘影响性状的重要调控元件和基因；

2.开发高通量实验和计算方法，在动物体内和单细胞层面，鉴定影响增强子功能的DNA变异，并以此为切入点，挖掘影响性状的关键基因；

3.开发实验和计算方法，结合高通量调控元件数据进行调控元件序列底层逻辑的解析，优化和设计新一代调控元件和细胞线路，通过合成生物学手段为性状改良提供基因功能模块；

4.开发低成本高密度的新一代基因型检测方法，开发结合多组学数据和深度学习的全基因组选育方法和精细定位方法，协助推进畜牧动物品种选育和性状改良。

课题组科研气氛良好，指导老师会为每一个成员根据其自身兴趣和特点设定培养方案，因材施教，并根据成员日后发展需求尽力提供各种资源。课题组成员团结互助，凝聚力强，为新人的融入提供了友好且有力的支撑环境。再此，我们欢迎对国家民族发展有担当，对科技创新有热情，愿意接受挑战的志同道合之士加入我们。让我们共同努力，立德立言，无问西东。

一、招聘岗位

根据团队工作需要，拟面向动物遗传育种与繁殖、生物信息学、功能基因组等方向招聘博士后1名、副研究员1名、科研助理2-3名、实验室技术人员2-3名。

二、应聘条件

博士后

1.近三年内获得博士学位，年龄小于35岁。

2.近三年以第一作者或共同第一作者（排名第一位）发表中科院二区及以上的SCI论文至少1篇。有良好的独立思考能力和英文能力。

3.对科研有浓厚的兴趣，具有科研创新能力，勤于思考，能独立开展课题研究，学术态度严谨，善于团队合作。

4.熟悉分子生物学实验，具备多组学文库构建研究经验者优先考虑。

5. 可选择方向包括：（1）产生多组学数据解析生猪经济性状形成的遗传基础。（2）开发和用高通量方法定量海量调控元件活性，探索调控元件的时空特异性以及和环境的互作，并与生信分析人员合作通过人工智能手段设计符合需求的调控元件和细胞调控线路。（3）在动物体内和单细胞层面，开发高通量调控元件活性定量方法，与生信分析人员合作结合群体遗传学数据解析复杂性状形成的遗传基础。（4）开发方法高通量定量植物调控元件活性，通过优化表达载体，优化植物底盘生产高附加值蛋白的效率。

副研究员

1.近三年以第一作者或共同第一作者（排名第一位）发表中科院一区及以上的SCI论文至少2篇。

2.对设计课题和申请项目有充足的经验。

3.对科研有浓厚的兴趣，具有科研创新能力，勤于思考，能独立开展课题研究，学术态度严谨，善于团队合作。有良好的沟通能力和中英文科技写作能力。

4.可选择方向包括：（1）产生多组学数据解析生猪经济性状形成的遗传基础。（2）开发和利用高通量方法定量海量调控元件活性，探索调控元件的时空特异性以及和环境的互作，并与生信分析人员合作通过人工智能手段设计符合需求的调控元件和细胞调控线路。（3）在动物体内和单细胞层面，开发高通量调控元件活性定量方法，与生信分析人员合作结合群体遗传学数据解析复杂性状形成的遗传基础。（4）开发方法高通量定量植物调控元件活性，通过优化表达载体，优化植物底盘生产高附加值蛋白的效率。

科研助理（基因组选择或生信品种鉴定）

1. 具有硕士研究生及以上学历，有经验本科亦可，专业包含但不限于生物信息学、统计学、生物学等，具有相关工作经验学历可放宽条件。

2.具有良好的理解能力，良好的编程能力，认同并热爱基因组学研究或者算法开发工作。

3.以主要参与人完成一款生物信息学（或其他学科）算法软件者优先；发表方法学学术论文者优先。

4.基因组选择方向：负责多组学数据整合分析，负责基因组选择方法开发；或生信品种鉴定方向：负责利用生物信息学方法进行品种鉴定，负责品种鉴定相关分析方法及流程研发。

5.完成上级交付的其它相关工作。

实验室技术员

1.具有硕士研究生及以上学历，有经验者本科亦可。

2.熟练掌握pcr分子实验技术，熟悉二代测序技术。

3.精通常见高通量建库原理，流程，熟悉常规建库方法。

4.负责二代测序项目的建立工作；优化开发，逐步建立高效低价的自动化建库流程；负责相关设备的保养与维护；负责NGS相关检测服务和产品研发。

5.完成上级交付的其它相关工作。

三、薪资待遇

博士后

1. 按照深圳市相关规定，博士后在站期间享受在站博士后生活补贴，具体金额以政府最新规定为准。

2. 按照研究所的相关规定提供博士后的工资、五险一金和绩效待遇。

3. 符合条件的，可申请“博士后创新人才支持计划”、“博士后国际交流计划派出项目、引进项目”、广东省海外博士后人才支持项目、中国农业科学院博士后“优农计划”，在站期间可申报“中国农业科学院优秀博士后”评审，入选者给予奖金奖励。

4. 博士后人员进站后，可选择落户深圳市，其配偶及未成年子女可办理随迁入户。

5. 符合条件的博士后可申请评定专业技术资格。

6. 深圳市对出站博士后留深工作、签订3年劳动合同的，给予30万元资助，用于科研投入或创业前期费用。

7. 提供良好的工作环境和充足的研究经费，配备研究需要的设备和仪器，科研方向给予较高自由度。

副研究员

1.出站博士后后优先考虑，待遇为年薪税前30-50万元/年，同时可享受研究所其他非薪资类绩效和奖励。

2.符合相关人才条件，可依托基因组所申请广东省、深圳市人才生活补贴。

3.遴选入职后可选择落户深圳市，其配偶及未成年子女可办理随迁入户。

4.遴选入职后，符合条件可依托挂靠研究中心开展科研工作。符合条件可申请中国农业科学院青年英才计划培育项目，享受中国农业科学院青年英才计划待遇。

科研助理

1. 7000~15000元/月，最终数额将根据应聘者个人具体条件确定。

2. 缴纳深圳市五险一金。

3. 提供良好的科研环境，有机会发表文章、推荐到国内外知名高校和科研单位深造学习。

实验室技术员

1. 7000~15000元/月，最终数额将根据应聘者个人具体条件确定。

2. 缴纳深圳市五险一金。

3. 提供良好的科研环境，有机会发表文章、推荐到国内外知名高校和科研单位深造学习。

四、申请方式

申请者请将个人简历（包含教育经历、研究经历、论文发表、国内外任职证明、个人最高学术水平成果、项目、专利证书和奖励等）、代表作、未来计划和研究意向以电子邮件形式发送至：liuyuwen@caas.cn，邮件主题和材料压缩文件请注明“姓名+岗位”。

应聘者材料将严格保密，并在通过简历筛选者将安排面试，未进入面试者，不再另行告知。

工作地点：深圳市大鹏新区布新路97号。

中国农业科学院深圳农业基因组研究所2023年招聘启事